Порядок организации и проведения научной работы в Академии регламентируется следующими документами: «Положение о научно-исследовательской работе», «Положение о студенческом научном обществе», планами научно-исследовательской работы годовыми и перспективными, годовыми отчётами о НИР. Для организации научных исследований в Академии создана научно-исследовательская часть (НИЧ), деятельность которой регламентируется Временным Положением о хозрасчётной научно-исследовательской части Академии, утвержденным ректором. В составе НИЧ функционирует 3 научно-исследовательских лаборатории (НИЛ). За организацию и проведения НИР в Академии отвечает проректор по научной работе. Координацию научно-исследовательской деятельности, подготовку мероприятий по совершенствованию организации и управления научной работой, повышение её эффективности и укреплению связей научного и учебного процессов осуществляют 6 научно-методических комиссий, назначенных приказом ректора.
Ежегодно в Академии формируются планы научной работы, утверждаемые Учёным Советом и ректором академии. К выполнению научных тематик участвует большинство профессорско-преподавательского состава кафедр и лабораторий, а также представители организаций и учреждений, с которыми работают кафедры на основании договоров о сотрудничестве.
Научные руководители комплексных тем утверждаются Учёным Советом. Научные руководитель тем, выполняемых по хоздоговорам, назначаются, как правило, из числа заведующих кафедрами приказом ректора по представлению руководителя НИЧ. Из 42 профессоров академии, в том числе заведующих кафедрами 28 принимают активное участие в НИР.
На научного руководителя возложена ответственность за выполнение научной работы, достижение запланированных результатов в определенные сроки, эффективное использование материальных ценностей. Участие каждого сотрудника академии в выполнении НИР отражены в индивидуальных планах работы преподавателей, годовых планах и отчётах кафедр. Научно-исследовательская работа академии сегодня реализует научные исследования по решению ряда приоритетных прикладных проблем в области ветеринарии, зоотехнии, биологии по 6 основным направлениям, соответствующим профилю подготовки специалистов:
- Разработка системы защиты животных с целью создания ветеринарного благополучия животноводства. Усовершенствование и создание новых методов диагностики, способов лечения и профилактики, способствующих повышению продуктивности и сокращению потерь животных. Создание новых и усовершенствованных биологических и лечебных препаратов.
- Усовершенствование методов ветеринарно-санитарного надзора и ветеринарно-санитарной экспертизы с целью улучшения биологической ценности и доброкачественности кормовых и пищевых культур.
- Изучение физиологических и биохимических характеристик животных, разработка методов повышения продуктивности стада на основе их коррекции.
- Эколого-генетический мониторинг в животноводстве; разработка новых методов оценки генетической нестабильности клеток, связанной с действием мутагенов среды, в целях профилактики нарушений жизнеспособности и воспроизводительной функции животных.
- Разработка теоретических основ физических методов лечения и профилактики болезней животных с незаразной этиологией.
- Разработка научно обоснованной схемы оздоровления неблагополучных стад крупного и мелкого рогатого скота по кампилобактериозу и бруцеллёзу.
Научная тематика академии тесно увязана с интересами региона и выполняются в рамках научных договоров. Подавляющее большинство научных тем академии посвящено изучению лечебно-профилактических мероприятий, поиску новых эффективных биопрепаратов, вакцин, сывороток, иммуностимуляторов, применительно к интенсивным технологиям промышленного животноводства, внедряемых в Ленинградской области.
В 2005 году открыта новая клинико-биохимическая лаборатория, которая оснащена современным оборудованием (ПЦР-анализатор, полуавтоматический биохимический анализатор, система визуализации изображения “ВидеоТест”, включающая бинокулярный микроскоп “Axiostar plus” производства “Zeiss” (Германия) с фотокамерой “Pixera”, гематологический анализатор), что позволяет проводить научно-исследовательскую работу на высоком научно-методическом уровне.
